Quantitative Structure–Property Relationship (QSPR) of Active Compounds from Momordica charantia as Antidiabetic Agents

Abstract

Latar belakang: Momordica charantia (pare) mengandung beberapa senyawa aktif seperti momordenol, lanosterol, cucurbitacin, stigmasterol, dan cucurbitin yang diketahui memiliki potensi sebagai antidiabetes. Tujuan: Penelitian ini bertujuan untuk menentukan hubungan antara parameter fisikokimia senyawa aktif M. charantia dengan aktivitas antidiabetes yang diprediksi menggunakan model Hubungan Kuantitatif Struktur–Properti (HKSP). Metode: Parameter fisikokimia yang meliputi lipofilik (logP, logS), elektronik (Etot, pKa), dan sterik (MR, BM) dihitung menggunakan perangkat lunak ChemBioDraw 2D, ChemBio3D, dan ChemBio3D Ultra. Molecular docking dilakukan menggunakan program Molegro Virtual Docker (MVD) terhadap protein tirosin kinase reseptor insulin terfosforilasi (PDB ID: 1IR3). Analisis statistik dilakukan menggunakan IBM SPSS untuk memperoleh model regresi HKSP terbaik. Hasil: Persamaan regresi optimum yang diperoleh adalah: Rerank Score = (–0,356 MR) – 33,915 (n = 5; r = 0,995; R² = 0,9908; SE = 1,919; F = 321,35; sig = 0,0003). Parameter fisikokimia yang paling berpengaruh terhadap aktivitas antidiabetes adalah massa molekul relatif (MR). Dari kelima senyawa yang diuji, cucurbitacin menunjukkan afinitas ikatan terbaik dengan nilai rerank score –85,7314. Kesimpulan: Hasil penelitian menunjukkan bahwa senyawa aktif dalam M. charantia, khususnya cucurbitacin, berpotensi dikembangkan sebagai kandidat alami antidiabetes melalui pendekatan komputasi dan eksperimental.